Spahn und die Fxxxx sind unfähig. Wir Bürger nehmen die Pandemiebekämpfung jetzt selber in die Hand! (mT)

DT @, Freitag, 20.03.2020, 23:47 vor 2152 Tagen 1359 Views

bearbeitet von DT, Freitag, 20.03.2020, 23:55

Email eines Freundes von mir heute nachmittag:

Ich hab bei ihm angefragt, wie schwer es ist, PCR Maschinen für die Testzentren zu beschaffen, denn die Politik ist unfähig, einfach mal bei den Unis und Max Planck Instituten anzufragen, wo Dutzende dieser Geräte stehen, damit wir endlich schneller testen können, wie auch die Koreaner, und sich unsere Grundgesamtheit erhöht, ein wichtiger Punkt von DarkStar.

Hier ist seine Antwort:

"An sich ist RT-qPCR kein Hexenwerk. Hier ist ein low budget set-up: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.7b04843

Deren Design kommt auf 70 Euro und mit den Kollegen könnte solch ein Prototyp binnen Wochenfrist nachgebaut und eventuell auch weiter optimiert werden. Wenn wir RT-qPCR Geräte billig und in Masse fertigen können wäre der Flaschenhals auch gestopft.

Hier würden wir dann nur Test-Reagenzien nehmen, welche den echten Test dann simulieren. Danach könnten wir dann Testsysteme an die Virologie schicken - eventuell auch an die Bundeswehr.

Ein Freund von mir hat da mit dem Labor zusammengearbeitet, welches das Webasto-Cluster Anfang Januar in München begleitete. Da würde ich aber erst anklopfen wollen, wenn wir einen konkreten Plan haben.

Physikalisch limitierend sind die Temperaturzyklen (Fig 2D). Da wird mit jedem Zyklus der DNA Doppelstrang geschmolzen und dann auf niedriger Temperatur wieder ein neuer Strang entlang des Einzelstranges aufgebaut. Könntest Du mit Deiner Firma mal die Konstruktion näher analysieren, inwieweit die Temperatur sich schneller in die Probe hinein oder heraus bringen ließe, vielleicht mit einem Laser.

Gleichzeitig wird ein Zugang für die Optik gebraucht (Fig 3C) - ein Faktor 10 in der Empfindlichkeit würde genauso Zeit sparen. Wichtig wäre auch ein bar-code scanner mit Datenbank-Anbindung, um die Ergebnisse entsprechen zusammenzuführen.

Unter der Ägide des Kanzleramtes läuft gerade https://wirvsvirushackathon.org an.

Aktuell gibt es da eine längere Ideenliste, wie sich Testprozesse optimieren lassen aber auch zum Corona-Tracking. Primär werden da wohl neue Apps bei rumkommen, aber es lohnt sich, dies im Blick zu halten.

Prinzipiell sollte sich solch ein RT-qPCR Aufbau über die Platform dann aber Deutschlandweit sehr schnell skalieren lassen. Aktuell wohl 40 000 registrierte Freiwillige."


Fuck die Rosette und die Fxxxx, wir sind doch noch nicht ganz bescheuerte Lemminge und warten darauf, daß diese inkompetenten Volkszerstörer und Nichtstuer unser Land ruinieren. Wir machen das jetzt selber! Und wir fragen bei anderen Firmen an, ob die mitmachen. Genügend Maschinenbauer, Feinmechaniker etc. gibt es ja wohl in D, und es braucht Pipettierroboter, Thermocycler etc. Alles kein Hexenwerk. So einen Roboter kann ja schon ein Schüler mit einem Arduino programmieren!


PS: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.7b04843

An Affordable and Portable Thermocycler for Real-Time PCR Made of 3D-Printed Parts and Off-the-Shelf Electronics

Anal. Chem. 2018, 90, 9, 5563-5568
https://doi.org/10.1021/acs.analchem.7b04843

Abstract

The polymerase chain reaction (PCR) is a sought-after nucleic acid amplification technique used in the detection of several diseases. However, one of the main limitations of this and other nucleic acid amplification assays is the complexity, size, maintenance, and cost of their operational instrumentation.

This limits the use of PCR applications in settings that cannot afford the instruments but that may have access to basic electrical, electronic, and optical components and the expertise to build them. To provide a more accessible platform, we developed a low-cost, palm-size, and portable instrument to perform real-time PCR (qPCR). The thermocycler leverages a copper-sheathed power resistor and a computer fan, in tandem with basic electronic components controlled from a single-board computer.

The instrument incorporates a 3D-printed chassis and a custom-made fluorescence optical setup based on a CMOS camera and a blue LED. Results are displayed in real-time on a tablet. We also fabricated simple acrylic microdevices consisting of four wells (2 μL in volume each) where PCR reactions take place. To test our instrument, we performed qPCR on a series of cDNA dilutions spanning 4 orders of magnitude, achieving similar limits of detection as those achieved by a benchtop thermocycler. We envision our instrument being utilized to enable routine monitoring and diagnosis of certain diseases in low-resource areas.

Low resource area wie Deutschland nach der Spahn'schen Gesundheits-Reform.

So sieht das Ding aus. 70 EUR:

[image]

Ich werde doch wohl eine Firma finden, die momentan Kurzarbeit macht und mir hilft, das Ding zu bauen!

RT-PCR und Prozesse

Centao @, Samstag, 21.03.2020, 00:57 vor 2152 Tagen @ DT 1298 Views

Hallo DT,

hier mal was populäres von Arstechnica zu den Prozessen rund um die RT-PCR und COVID-19.

Es sind mit Sicherheit - um einigermaßen valide Aussagen zu erreichen, Fachleute in der Interpretation und dem Prozesshandling nötig. Die Qualität bei der RT-PCR liegt gerade auch in der Algorithmik (ABI Solid Sequencing) und Signalverarbeitung. 2003/2004 haben wir diese in D mitentwickelt, inzwischen machen z.B. Illumina oder Thermo-Fisher das dicke Geschäft.

Die Makeriniative (Hacking) finde ich auch spannend, aber ohne Laborunterstützung ist in der PCR Analyse kein Blumentopf gewinnbar. Testkit wie [link=Genekam Biotechnology AG]hier[/link] oder TIB für 5 - 15 USD sind m.E. der Weg, den jedes Klinik-/Biolabor gehen kann.

Gruß,
CenTao

Danke CenTao für den konstruktiven Beitrag! (mT)

DT @, Samstag, 21.03.2020, 01:44 vor 2152 Tagen @ Centao 1324 Views

Das ist genau was ich suche. Ich bin kein Biologe, kenne mich daher nicht allzutief mit PCR aus, aber ich weiß, daß die Chemikalien in Verbindung mit Thermocycling und Pipettierrobotern plus Auslese in einer Art Chromatographie wesentlich sind.

In einer konzertierten Aktion von Wissenschaftlern, Technikern, Informatikern, Schraubern und Firmen muß doch sowas machbar sein!

Klar könnte Qiagen jetzt versuchen, 10000 Maschinen herzustellen, aber das wird nicht gehen. Daher brauchts grassroot Ansätze!

Ironisch, daß jetzt die Chinesen sagenhafte 500 Ärzte und Helfer nach Italien schicken und Material. Das ist sehr bewegend. Ich habe auch auf Maas eingeschlagen wegen dem Geschenk der Schutzmaterialien, aber das könnte sich in den nächsten Wochen noch verdammt auszahlen, wenn das 10-fache in der anderen Richtung zurück kommt und uns literally den Arsch rettet. Die Krise zeigt aber: wir sind verloren. Sowohl von der Führung her als auch vom Personal darunter als auch von den Bürgern her.

Wenn gute Vorschläge wie von mir von Zynikern wie Mephisto mit einem "Händewaschen" kommentiert werden und die Jugend Coronaparties macht, die der Spiegel dann auch noch wegen der Subversivität und im Vergleich mit der Prohibition als "cool" darstellt, und wenn alle nur noch da sitzen und warten und ihr Schicksal nicht mehr in die eigenen Hände nehmen, dann hat dieses dekadente und nicht lebenstüchtige Volk den Untergang verdient.

Ich gehe nach Singapore oder Taiwan und verbringe dort meinen nächsten Lebensabschnitt, die Einstellung der Leute dort paßt besser zu meinem Charakter als dieses Volk hier. Wie sagte die Drecksfxxxx einmal: Das ist nicht mehr mein Volk. Das kann ich jetzt auch sagen.

Jaaaaaaaaaa!

DarkStar @, Samstag, 21.03.2020, 11:21 vor 2151 Tagen @ DT 1264 Views

Ich gehe nach Singapore oder Taiwan und verbringe dort meinen nächsten Lebensabschnitt, die Einstellung der Leute dort paßt besser zu meinem Charakter als dieses Volk hier.


Jaaaa, bitte! Am besten noch heute mit dem letzten Flieger! Und bitte nicht nur Lebensabschnitt! Im ernst, das passt definitiv besser: da rennen IMMER fast ALLE mit Mundschutz rum, und der Alarmismus ist ganz natürlich schon um einiges höher. Kinder werden in Watte gepackt, weil ja sonst irgendwas passieren könnte und Panik kommt viel schneller auf -- das ist deine Bühne, Rot-Alarmist @DT. Bitte geh!

--
DS
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"Things usually work --- until they dont."

Schon wieder blinder Aktionismus. Aber wenigstens ist der nicht so teuer, wie...

DarkStar @, Samstag, 21.03.2020, 01:52 vor 2152 Tagen @ DT 1301 Views

... deine ShutDown-Forderungen. Aber es geht doch VIEL einfacher!

Nimm doch das Zahlenmaterial was da ist. Und wenn etwas fehlt, muss man fragen warum das fehlt und wer dafür verantwortlich ist, dass es fehlt.

--
DS
---
"Things usually work --- until they dont."

Meinst Du solcherart Tests?

MausS @, Samstag, 21.03.2020, 04:21 vor 2152 Tagen @ DT 1271 Views

Wie diese hier erwähnten etwa?

Echt jetzt?

--
„Wir Feinde des allgemeinen Wahlrechts hören nicht auf, uns über den Enthusiasmus zu wundern, den die Wahl einer Handvoll Unfähiger durch einen Haufen Inkompetenter weckt.“ Nicolas Gomez Davila

Bitte bring mir die Originalquelle, wo Kary Mullis sagt, daß sein PCR Test keine spezifischen Coronaviren nachweisen könnte. (mT)

DT @, Samstag, 21.03.2020, 16:19 vor 2151 Tagen @ MausS 1295 Views

Was ist die Quelle [10]?

Woher ist Dein Zitat? Aus dem Buch von Gerhard Wisnewski von 2015?

https://oeh.univie.ac.at/zeitgenossin/kary-mullis-ein-zweifelhaftes-vorbild-fur-die-wis...

Oder meinst Du etwa seine Anhängerschaft mit Peter Duesberg, einem Leugner des HIV-Virus?

Ob unser Freund Gerhard Wisnewski hier auch mitschreibt?

https://www.nachrichtenspiegel.de/2020/03/15/ausnahmezustand-gerhard-wisnewski-bei-stei...

Wenn es sonst niemand wagt ...

NST @, Südthailand, Samstag, 21.03.2020, 04:31 vor 2152 Tagen @ DT 1309 Views

bearbeitet von NST, Samstag, 21.03.2020, 04:45

eine "begrenzte und wertvolle Ressource".

https://www.faz.net/aktuell/politik/inland/coronavirus-krise-wer-darf-sich-noch-testen-...

Wie der erfahrene Statistiker DarkStar weiß, erhöht sich die Zuverlässigkeit beim random sampling mit dem Größe der Grundgesamtheit. Und die sollte unter allen Umständen erhöht werden.

.... dann muss ich den ersten Schritt machen.

Der Stil von DT hat grosse Ähnlichkeit mit -Pöbel Ralle- . Das wurde bisher immer von allen geschluckt. Inzwischen hat das aus meiner Sicht eine ganz andere Qualität erhalten.

Warum?

Ich habe früher in meiner Ex-Firma als Zulieferer für diverse Pharma Unternehmen gearbeitet. Auch war ich gut bekannt mit einem Verkäufer unseres Hauses - denn der war mit einer Thai verheiratet. Der deckte den ganzen Bereich Asien u. Australien ab, für eine kurze Zeit auch Südamerika. Wie da Geschäfte angebahnt werden ist mir nicht entgangen - auch nicht was für Provisionen fliessen. [[zigarre]]

Dazu kommt noch, dass meine Erfahrungen bis runter in die Produktionshallen geht, denn dort war mein eigentlicher Einsatzort. Inzwischen habe ich Lunte gerochen.

So wie ich das sehe, arbeitet DT direkt für Pharma Firmen oder für Zulieferer und zwar in einer Position die dem eines Verkäufers gleicht. Sein ganzes Reiseprofil das er hier immer so schön promotet hat, sind ein Indiz dazu. Dazu kommen noch die Fachtermini - die hat er drauf, all das was man als Verkäufer wissen muss ..... :-P

Soweit mal meine ersten Unterstellungen. Nichts ehrenrühriges - aber es könnte zu einem Augenöffner werden.
Gruss

PS: zur Erinnerung ... Vorerkrankungen der diagnostizierten Viren Toten ....

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Jeder arbeitet im Ausmass seines Verstehens für sich selbst und im Ausmass seines Nicht-Verstehens für jene, die mehr verstehen!

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